Chapter 6
1、细胞基质(cytoplasmic matrix):存在于细胞质中,填充于N.M,ER,Golgic,C等液泡系统与Mito chloroplast 等膜状结构之间的连续性结构,主要含有与中间代谢有关的糖4种酶类,与维持细胞形态和细胞内物质运输有关的细胞质骨架结构。
2、胞质深胶(cytosol):属细胞质的可流动部分,并且是膜结合cell器外的流动部分。它含有多种蛋白和酶以及参与生化反应的因子,cytosol 为protein合成的重要场所,同时还参与多种生化反应。
3、cell内膜系统(cell endomembrane syslem):指细胞质内在形态结构,功能和发生上具有相互联系的膜相结构的总称,由膜围绕的细胞器或细胞结构,主要包括N.M,ER,Glogic,lysosome,胞内体和分泌泡等。
4、跨膜运输(across memirane transport):cytosol中合成的protein进内到ER.Golgic,mito,chlo和过氧化物酶体通过一咱跨膜机制进行定位,需要膜上运输protein的帮助。被运输的protein常为未折叠的状态。
5、小泡运输(transport by vecicles):protein从ER转运到Golgi,以及从Golgi转送到深酶体分泌泡CM细胞外等是由小泡介导的,这种小泡称运输小泡transport vesicles。内膜系统的protein定位,除了ER本身之外,其它膜结合细胞器的蛋白定拉都是通过形成运输泡,将protein从一个区室转送到另一个区室。
6、微粒体(microsomes):指在cell匀浆和差速离心过程中获得的由破碎的内质网自我融合形成的近球形的膜囊泡状结构。
7、内质网(ER):由封闭的膜系统及其围成的腔形成互相沟通的网状结构。
8、肌质网:心肌和骨骼肌中一种特殊ER,功能是参与肌肉收缩活动,SER在肌 cell中形成的一种特异结构。
9、信号识别颗粒(SPR):是一种核糖核酸酸蛋白复合体,有三个功能部位——翻译暂停结构域,信号肽识别引进结合位点,SRP受体蛋白结合位点,介导核糖体附着到ER膜上。
10、停*蛋白:DP即SRP在ER膜上的受体蛋白。
11、起始转移信号:
12、内含转移信号:又称内含信号肽
13、停止转移肽:又称停止转移信号
14、Golgi complex:由平行排列的扁平膜囊,大囊泡和小囊泡等等3种膜状结构组成——有两个面,形成面和成熟面
与cell的分泌功能有关,能够收集和排出内质网所合成的物质,且参与与糖蛋白和粘多糖的合成。
顺面网状结构、顺面膜囊、中国膜囊、反面膜囊、反面网状结构
15、内质网滞留信号:内质网的功能和结构蛋白羧基端的一个同肽系列:
Lys-Asp-Gly-Leu-Coo-,即KDEL信号序列,在Golyi膜上有担应受体,一旦进入Golyi就与受体结合,形成回流水泡被运回ER。
16、M6P受体蛋白:为反面高尔基网上的膜整合蛋白,能够识别lysosome水解酶上的M6P信号并与之结合,从而将lysosome的酶蛋白分选出来,后通过出芽的方式将该酶蛋白装入分泌小泡。
17、细胞分泌cell secretion:animal and plant cell将在KER上合成而又非内质网组成的protein和脂通过小泡运输的方式经过Golyi body的进一步加工和分选运送到cell内相应结构,CM以及cell外的过程称为细胞分泌,分泌活动可分为两种——
a.分泌的物质主要供cell内使用
b.要通过与cell质膜的融合进入CM或运输到cell外
18、cell表面整联蛋白介导信号传递:
Integrin是cell表面的跨膜蛋白,由α和β两个亚基组成的异二聚体,在胞外段具有多种胞外基质组分的结合位点,包括,纤连蛋白,胶原和蛋白聚糖。Integrin不仅介导cell附着胞外基质中,还提供了一种cell外环境调控cell内活性的渠道,integrin的胞外结构与胞外配体相互作用,可产生多种信号,如Ca2+释放,肌醇第二信使的合成,这些signal对cell具有深远影响,诸如cell生长迁移,分化及至生存。
19、cell与cell外基质形式粘着斑:通过粘着斑由integrin介导的信号通路。
a.由cell表面CN的signal通路。
b.由cell表面到CP核糖的信号通路。
20、蛋白质的定向转运或分选:除线粒体和叶绿体中能合成少量protein外,绝大多数的protein均在细胞质基质中的核糖体上开始合成,然后转运至cell的特定部位,也只有转运至正确的部位并装配成结构和功能的复合体,才能参与cell的生命活动。这一过程称protein的定向转运。
21、分泌性蛋白信号假说:即分泌性蛋白N端序列作为信号肽,指导分泌性蛋白到内质网膜上合成在蛋白质合成结束之前信号肽被切除。指导分泌性蛋白在rER上合成的决定因素是蛋白质N端的信号肽,信号识别颗粒和ER膜上的信号识别颗粒受体(又称停泊蛋白),等因子协助完成这一过程。
22、共转移:protein首先在基质游离核糖体上起始合成,当多肽链延伸至80个aa左右后,N的信号序列号信号识别颗粒结合使肽链延伸暂时停止,并防止新肽N端损伤和成熟前折叠,有至信号识别颗粒与内质网膜上的偏激蛋白(SRP受体)结合,核糖体与内质网膜上的易位子结合,此后SRP脱离了信号序列和核糖体,返回细胞质基质中重复使用,肽链又开始延伸。以环化构象存在的信号肽和与易位了组分结合并使孔道打开,信号肽穿入内质网膜并引来肽链以袢环的形式进入内质网腔中,这是一个需GTP的耗能过程,与此同时,腔面上的信号肽被切除。肽链继续延伸直至完成整个多肽链的合成。这种肽链边合成边转移至内质网腔中的方式称共转移。
23、后转移:线粒体、叶绿体中绝大多数protein和过氧化物酶体中的protein在导肽或前导肽的指导下进入这些细胞器,这种转移方式在protein跨膜过程中不仅需要ATP使多肽去折叠,而且还需要一些protein的帮助使其能够正确地折叠成有功能的蛋白。这些蛋白基本的特征在细胞质基质中合成以后再转移到这些细胞器中,因此称后转移。
24、蛋白质另选的基本途径:
a.一条是在细胞质基质中完成多肽链的合成,然后转送至膜围绕的细胞器,如线粒体,过氧化物酶体,细胞核及细胞质基质的特定部位,有些还可能运至内质网中。
b.另一条是protein合成起始后转移至rER,新生肽边合成边转入rER中,随后经高尔基体运至深酶体,细胞膜腹或分泌到细胞外,内质网与高尔基体本身的protein成分的分选也通过这一途径完成。
25、protein分选的基本类型:
a.蛋白质的跨膜转送;b.膜泡运输;c.选择性的门控转送;d.细胞质基质中的protein的转送。
26、膜泡运输:
a.从ER向Golgi complex的膜泡运输;b.分泌小泡的外排运输;c.内吞小泡的运输。
27、分泌小泡:A.有被小泡→溶酶体酶;
B.衣被小泡→分泌蛋白;
C.分泌小泡→暂存于ER中。
28、有被小泡:A.网格蛋白有被小泡——负责protein从GolgiTGN向,质膜胞内体或溶酶体和植物液泡运输。
B.CopⅡ有被小泡——负责内质网到高尔基体的物质运输。
C.CopⅠ有被小泡——负责将protein从高尔基体返回
29、信号序列:
a.内质网驴留蛋白:C端含回收信号序列KKKK
b.分泌性蛋白:N端含信号肽
c.细胞器蛋白:含导肽或前导全肽
d.细胞核中蛋白:含核定位序列
30、rER的作用:protein的合成;protein的修饰加工;膜的生成;物质的运输;贮积Ca2+,为信号传递途径的Ca2+储备库。
sER的作用:合成脂类;含有G-6-P酶裂解糖原,参与糖原代谢;蛋白酶的水解及加工过程。
31标志酶:ER——葡萄糖-6磷酸酶;
Golgi complex——糖基转移酶;
Lysosome——酸性水解酶;
Peroxisome过氧化物酶体又称微体——过氧化氢酶。
Chapter7
1、分泌蛋白的运输过程:
a.核糖体阶段:包括分泌型蛋白质的合成和protein跨膜转送。
b.内质网运输阶段:包括分泌蛋白腔内运输,protein糖基化等粗加工和贮存。
c.细胞质基质运输阶段:分泌蛋白以小泡形式脱离粗面ER移向高尔基体,与其顺面膜表融合。
d.高尔基体复合体加工修饰阶段:分泌蛋白在Goli complex的扁平膜内进行加工,然后以大囊泡的形式进入细胞质基质。
e.细胞内腔阶段:大囊泡发育成分泌泡,向质膜移动,等待释放。
f.肚吐阶段:分泌泡与质膜融合,将分泌蛋白释放出胞外。
2、组成型分泌途径:运输小泡持续不断地从Golgi complex运送到CM,并立即进行膜融合,将分泌小泡中的protein释放到cell外,此过程不需要任何信号的触发,它存在于所有类型的cell中。
组成型分沁小泡称运输泡,由Golgi complex反面网络对组成型分泌蛋白的识别分选后形成的。
调节型分泌:又称诱导型分泌,见于某些特化的cell如分泌性cell。在这些cell中,调节型分泌小泡成群地聚集在CM下,只有在外部信号的触发下,质膜产生胞内信使后才和CM融合,分泌内容物。
调节型途径中形成的小泡称分泌泡,其形成机制不同于运输泡,调节型pass way有两特点:小泡形成具有选择性;具有浓缩作用,可使运输物质浓度提高200倍。
3、受体介导的内吞作用:
a.配体与膜受体结合形成一个小窝。
b.小窝逐渐向内凹陷,然后同CM脱离形成一个被膜小泡。
c.被膜小泡的外被很快解聚,形成无被小泡,即初级内体。
d.初级内体与深酶体融合,吞噬的物质被溶酶体的酶水解。
4、LDL经受体介导的内吞作用被吞入cell和被利用的过程:
LDL在CM的被膜小窝中与受体结合→小窝向内出芽→形成被膜小泡→网格蛋白去聚合形成无被小泡,即初级内体→内体调整PH至酸性,使LDL与受体脱离形成次级内体→受体被分拣出来,被载体小泡运回CM→通过膜融合,受体回到CM再利用→LDL被分选进入没有受体的小泡,与被次溶酶体融合形成次级溶酶体→在次级溶酶体中,protein降解成aa,胆固醇脂肪被水解。
氧化磷酸化偶联机制的化学渗透假说:
指电子传递链各组分在线粒体内膜中不对称分布,当高能电子沿其传递时所释放的能量次H+从基质泵到膜间隙,形成H+电化学梯度,在这个梯度驱使下,H+穿过ATP合成酶回到基质,同时合成ATP,电化学梯度蕴藏的能量储存到ATP高能磷酸链。
Chapter 8
1、线粒体:存在于细胞质内,由内外二层单位膜围成的囊状结构,内膜内凹陷形成线粒体嵴。嵴膜上有许多有柄小球体,即基粒,也称ATP酶复合体。内外膜之间的空隙称膜间隙,内膜以内的空隙的空隙为基质腔,充满着基质。
它为氧化磷酸化的关键装置,其内室为进行TcA循环的场所,为cell内能量转换系统,主要功能是产生ATP,提供生命活动所需要的能量。
2、半自主性细胞器:叶绿体、线粒体中即存在DNA(ctDNA,mtDNA),也有protein合成系统。但由于它们自身的遗传系统贮存信息很少,构建所需的信息大部分来处细胞核的DNA,所以它们的生物合成涉及到两个彼此分开的遗传系统。由于ctDNA,mtDNA信息太少,不能为自己全部的protein编码,所以它们只是一个半自主性细胞器,其遗传上由自身基因组和细胞核基因组共同控制,故称为半自主性细胞器。
3、叶绿体:由叶绿体膜,类囊体和基质三部分构成——
a.叶绿体膜由双层单位膜组成基主要成分为蛋白质和脂质;
b.类囊体是在叶绿体基质中,有许多由单位膜封闭形成的扁平小囊。在某些部位,许多圆饼状的类囊体叠置成垛,称基粒;
c.内膜与类囊体之间是流动性的基质,其中悬沲着片层系统。
4、内共生学说:认为线粒体和叶绿体分别起源于原始真核cell内共生的细菌和蓝藻。线粒体来源于细菌,即细菌被真核生物吞噬后,在长期共生过程中,通过演变,形成了线粒体。叶绿体来源于蓝藻,被原始真核cell摄入胞内,在共生关系中,形成了叶绿体。
证据:a.基因组大小,形态和结构方面与细菌相似;
b.有自己完整的蛋白质合成系统,能独立合成protein,且合成机制有很多类似细菌;
c.两层被膜有不同的进化源,外M与cell内膜系统相似,内M与细菌质M相似;
d.以分裂的方式进行繁殖,与细菌的繁殖方式相同;
e.能在异源cell内长期生存,说明线粒体和叶绿体具有的自主性和共同性的特征;
f.线粒体的祖先很可能来自反硝化融球菌或紫色非硫光合细菌;
g.发现介于胞内共生蓝藻与叶绿体之间的结构——蓝小体,其特征在很多方面可作为原始蓝藻向叶绿体演化的佐证。
不足之外:a.从进化角度:如此解释在代谢上明显占优势的共生体反而将大量的遗传信息,转移到宿主cell中,不能解释细胞核是如何进化来的,即原核cell如何演化为真核cell。b.线粒体和叶绿体的基因组中存在内含子,而真细菌原核生物基因组中不含有内含子,不能解释其内含子从何而来。
5、非共生起源学说:认为真核cell的前身是一个进上比较高等的好氧细菌,它比典型的原核cell大,这样就要逐渐增加呼吸作用的膜表面。开始是通过细菌CM的内陷,扩张和分化(形成的双层膜分别将基因组包围在其中),后形成了线粒体和叶绿体和cell核的雏形。
成功之处:解释了真核cell核被膜的形成与演化的渐进过程。
不足之处:实验证验不多;无法解释为何线粒体,叶绿体与细菌在DNA分子结构和protein合成性能上有那么多相似之处;对线粒体和叶绿体的DNA酶,RND酶和核糖体的来源也很难解释。
真核cell的细胞核能否起源于细菌的核区。
补充1:
线粒体外膜:(标志酶为单胺氧化酶)包围在线粒体最外面的一层单位膜,为线粒体界膜,厚约6nm,光滑而有弹性,构成成分protein和脂几乎相等,基上有孔蛋白,许多分子可自由通过,由于通透性高,使得膜间隙中物质几乎与胞质溶胶一样。脂质:蛋白质≈1:1。
线粒体内膜:(细胞色素氧化酶)位于外膜内侧包裹线粒体基质的一层单位膜结构,厚约6-8nm。内膜对物质的通透性很低,为线粒体行使正常功能提供了保证。物质进入要借助于膜上运输蛋白,分三类:运输酶类;合成酶类;电子传递和ATP合成酶类,脂质:蛋白质≈0.3:1。
膜间隙中标志酶为腺苷酸激酶,线粒体的基质为苹果酸激酶。
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