麻烦各位高手快来帮我啊，急

最近看王镜岩的生化，越看越觉得重点很多，难点也很多，特别是蛋白质的那部分。我就想象不出那两个二面角是怎么确定的，书上所画出的当Φ=0，和Ψ=0或者这两个角度有变化时其空间的变化，望高手能赐教。
还有就是蛋白质中它的螺旋和折叠会在那里出现，有什么规律可寻呢？二硫键的出现又有什么规律呢？望赐教[s:10]

蛋白质中它的螺旋和折叠会在那里出现，有什么规律可寻呢？二硫键的出现又有什么规律呢？

这是蛋白质结构预测和蛋白质折叠研究中的一个前言问题。

作为普通生物化学最粗略的回答是：

蛋白质中它的螺旋一般在刚性部位出现，有时在分子表面居多，折叠多在铰链部位或亚基或受体配体结合部位较多。

1。D. Whitford,Proteins Structure and Function,Wily,2005;
2。D.M.Wedster,Proteins Structure(MMB143);
3。李惟 等，蛋白质结构基础，吉林大学出版社，1990；
4。Ying Xu, Dong Xu, and Jie Liang (Eds.)BIOLOGICAL AND MEDICAL PHYSICS  BIOMEDICAL ENGINEERING  Springer  2007

两个二面角是怎么确定的，书上所画出的当Φ=0，和Ψ=0或者这两个角度有变化时其空间的变化，

看沈同 王镜岩  生物化学（上）第二版，143页，图3-51，
C2----a-碳原子-----N1共三点，两条相交的直线，它们确定的唯一的平面就是Φ=0，和Ψ=0的平面。

以下连接来自生物软件网(  http://www.bio-soft.net  )
沈 同、王镜岩 主编 生物化学（上 ）高教出版社 ，1990
下载：http://www.foodmate.net/lesson/09/1.pdf
沈 同、王镜岩 主编 生物化学（下 ）高教出版社 ，1991
下载：http://www.foodmate.net/lesson/09/2.pdf
欢迎来到免费考研网www.freekaoyan.com



英文专业书已经下完了，不是从本站下书已经下完了，我也该走了。。。

[ 本帖最后由 花仙子2008 于 2007-12-14 09:43 编辑 ]

补充:
蛋白质中它的螺旋和折叠与二面角和氨基酸序列有关,a-螺旋和beta-折叠可见:D.L.Nelson ,M.M.Cox,Lehninger Principles of Biochemistry,Freeman,2004,125页.

其他的螺旋和折叠的二面角和氨基酸序列特征看上面的参考书.

另外,蛋白质中a-螺旋一般似为11氨基酸残基居多,超过25个氨基酸残基很少。

蛋白质的构象与拓扑结构（蛋白质的构拓扑结构可以很粗略的理解为：蛋白质的二级结构的种类数量和排布规律，实际上它是一套以a-螺旋和beta-折叠为构象元件的一套蛋白质空间构象的表示方法，并建立有相应的数据库）也有关系。

蛋白质中它的螺旋和折叠的存在不是一成不变的，与溶液环境也有关。
比如在SDS中，蛋白质分子呈现螺旋结构。

可以参考：
Roger B.Gregory edits Protein-Solvent  interactions,Marcel Dekker,Inc,1995.

Kenneth .pMurphy edits ,Protein Structure, Stability, and Folding,Huamann  press,2001

其他略。